Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT7O43581 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT7O43581 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT7O43581 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT7O43581 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT7O43581 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT7O43581 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT7O43581 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT7O43581 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT7O43581 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT7O43581 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms