Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HTRA2O43464 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms