Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHF1O43189 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF1O43189 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF1O43189 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF1O43189 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF1O43189 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF1O43189 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF1O43189 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHF1O43189 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHF1O43189 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms