Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1BO15143 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms