Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFIT3O14879 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIT3O14879 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms