Protein–RNA interactions for Protein: O00560

SDCBP, Syntenin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBPO00560 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SDCBPO00560 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms