Protein–RNA interactions for Protein: O00217

NDUFS8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS8O00217 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS8O00217 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS8O00217 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms