Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM5B3KS81 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM5B3KS81 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms