Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOBPA7XYQ1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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