Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERINC4A6NH21 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms