Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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