Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
ANKRD39Q53RE8 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ANKRD39Q53RE8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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