Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF169-201ENST00000340911 2336 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 STEAP3-201ENST00000393106 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 AL356599.1-205ENST00000606388 3961 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 IKZF5-205ENST00000617859 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
KRTAP9-9Q9BYP9 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.5 ms