Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMM9Q9Y5J7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM9Q9Y5J7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms