Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GIT1Q9Y2X7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GIT1Q9Y2X7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms