Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
YBX2Q9Y2T7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms