Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP20Q9Y2K6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP20Q9Y2K6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms