Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVW-1Q9UQF0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms