Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FZD1Q9UP38 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms