Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF18Q9UNG2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms