Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms