Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms