Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATPIF1Q9UII2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms