Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms