Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA6Q9UF33 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms