Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCC2Q9P258 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCC2Q9P258 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms