Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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