Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EHD3Q9NZN3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms