Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23BQ9NYZ1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms