Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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