Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3EQ9NVU0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms