Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBRD1Q9NUN5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms