Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4GALTQ9NPC4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms