Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX5Q9H2C1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LHX5Q9H2C1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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