Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP4Q9C0A0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTNAP4Q9C0A0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms