Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXQ1Q9C009 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms