Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms