Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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