Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms