Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDF4Q9BRK5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDF4Q9BRK5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms