Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms