Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms