Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC5LQ99459 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms