Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCC1Q96S66 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms