Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms