Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL15Q96M94 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms