Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC114Q96M63 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms