Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms