Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms