Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms